凈化車間等級一般根據潔凈等級劃分可以分為：百級凈化車間、千級凈化車間、萬級凈化車間、十萬級凈化車間、三十萬級凈化車間。級別越低、潔凈度等級越高。

不同潔凈度等級的凈化車間應用如下：（1）十萬級凈化車間：十萬級凈化車間可用于很多的工業部門，比如電子行業，食品飲料的生產，醫藥工業也常常使用十萬級凈化車間。（2）萬級凈化車間：萬級凈化車間常用于液壓設備或氣壓設備的裝配，某些情況下也用于食品飲料工業，此外，萬級凈化車間在醫工業中也很常用。（3）千級凈化車間：千級凈化車間主要用于高質量光學產品的生產，精度控制要求較高的車間，還應用于涂布凈化車間的涂布頭。（4）百級凈化車間：百級凈化車間可用于醫藥工業的無菌制造工藝等，應用于植入體內物品的制造，如外科手術，包括移植手術，集成器的制造，那些對細菌感染特別敏感的病人的隔離治療等。

凈化車間的級別要求需要根據車間用途以及潔凈度要求來選擇，在合理設計的范圍內，選取滿足要求的換氣次數，降低能耗，做低耗運行的工程。