醫藥凈化工程工程采用的設計參數是根據《潔凈室施工及驗收規范》JGJ71-90和《醫院潔凈室建筑技術規范》YFB001-1995以及醫院甲方的要求，參照有關技術措施和醫藥凈化工程的設計經驗綜合考慮后確定的。根據醫院潔凈室的類型和數量、院方規劃的總面積、樓層位置，確定了潔凈室的平面布置，各個房間的室內設計參數詳見YFB001-1995規定。 

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    由于醫用凈化空調系統空氣處理工藝的特殊要求，其初投資一般較高，在符合規范的前提下，醫院常常會提出更高的要求，系統的經濟性也越來越受到關注。因此在確定醫藥凈化工程室內參數時，須考慮醫院水、電、氣和土建的現狀，醫院的環境、資金和需要，有所側重。
    室內溫、濕度主要是為醫護人員創造出有利于工作的舒服環境，滿足診療過程的嚴格要求。適宜的溫度對保持病人的體溫是必要的；濕度低會產生靜電和切口軟組織失水，濕度高使人不適、影響精細操作。本地常年空氣濕度較高，本工程對溫度嚴格控制、對濕度的上限嚴格控制、濕度的下限 要求降到次要位置。

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    室內空氣潔凈度，考慮到醫院的醫藥凈化工程對象多為老年以及病患者，控制傳染的要求特別強烈，提高潔凈度有利于增強自凈的能力，抵抗干擾；同時本醫藥凈化工程采用的醫用衛生型機組風量大，壓頭高，潔凈走廊和輔房均為十萬級,同時提高換氣次數。

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    室內正壓，為防止外部的污染空氣進入潔凈區域，保持室內潔凈度要求，各房間設計為正壓。由于潔凈室采用醫用氣密門，換氣次數較高。
    保證室內正壓要求的新風量為：新風量對維持室內正壓、稀釋并排除潔凈室內有害氣體，保證醫患人員的舒服性，起著至關重要的作用。