節能是我國可持續發展戰略中的重要能源政策。但長期以來，潔凈室工程節能設計中針對的主要矛盾是微粒，而節能問題一直未從根本上解決，引起高度重視。我國GMP達標的潔凈室工程建設規模迅速發展與擴大，需要從潔凈室工程設計上采取有力措施來降低能耗，節約能源，已到了刻不容緩的地步，而從建筑布局、工藝條件上采用先進的節能技術和措施，可降低能耗和生產成本。 

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    1、設計合適的車間型式
    現代潔凈廠房以建造單層大框架正方形大面積廠房優異。其顯著優點是外墻面積特別小、能耗低，可節約建筑、冷熱負荷的投資和設備運轉費用。另外，可控制和減少窗墻比，加強門窗構造的氣密性。此外，在有高溫差的潔凈室工程項目中設置隔熱層，圍護結構采用隔熱性能和氣密性好的材料及構造，建筑外墻內側采用保溫或夾芯保溫復合墻板;在濕度控制房間設置有良好防潮性能的密封室：這些措施均能達到節能的目的。
    2、減少潔凈空間體積
    潔凈空間的減少，意味著風量比、換氣次數、送風動力消耗都隨之降低。潔凈室工程每平方米耗能是普通空調辦公樓的10---30倍。若減少潔凈體積30％，可節能25％。又由于1萬級潔凈區電耗是10萬級的2.5倍，因此，企業應按不同的空氣潔凈度等級要求分別集中布置，盡優性價比方案，努力減少潔凈室工程特別是高等級潔凈室工程的面積，同時，應使潔凈度要求高的潔凈室工程盡量接近空調機房，以減少管線長度，降低能源損耗。 

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    3、降低潔凈室工程污染值
    降低潔凈室工程的污染值有利于潔凈室工程的節能。潔凈室工程空氣的主要污染源不是人，而是新型建筑裝飾材料、清潔劑、粘接劑、辦公用品等。因此，使用低污染值的綠色環保材料，可使潔凈室工程的污染狀態很低，這也是減少新風負荷，降低能耗的很好的途徑。
    4、合理設計空氣潔凈等級
    在潔凈室工程設計中，對空氣潔凈度等級標準的確定，應在保證生產質量的前提下，綜合考慮工藝生產能力、設備的大小、操作方式和前后生產工序的連接方式、操作人數、設備自動化程度、設備檢修空間、設備清洗方式等因素，以降低投資和運行費用，達到節能要求。一是按生產要求確定凈化等級，如對注射劑稀配可定為1萬級，而濃配對環境要求不高，可定為10萬級。二是對潔凈度要求高、操作崗位相對固定的場所使用局部凈化措施。如大輸液的灌封等可在1萬級背景下局部100級的生產環境內操作。三是允許隨生產條件的變化調整生產環境潔凈要求。如注射劑稀配1萬級，當采用密閉系統時生產環境可為10萬級。